青溪镇的灵根检测站，是镇里最热闹的地方——不是因为测灵的人多，是因为测出来的结果总带着股旁人摸不透的古怪劲儿。每个人的灵根都封在一本泛黄的旧书里，书页的厚薄对应灵根的强弱，缺了页的灵根，人会没来由地犯些怪病，甚至短命；补灵的规矩只有一条：得找到对应页码的旧书残页，而且残页上的字，得和当年丢书的人沾着干系。
陈掌柜是镇口修书铺的老板，他的纸灵根已经缺了三个月。每次测灵的小周都皱着眉，指着灵根旧书的页码说，他的灵根缺了十七、二十三、四十一这三页，像是被人硬生生撕走的。陈掌柜自己门儿清，这三页是二十年前弄丢的——那年镇国公府整理旧藏书，他被请去搭手，翻到《青溪志》时，这三页突然没了踪影，他被镇国公扣了三个月俸禄，还在灵根检测站挂了号，说他的灵根从此留了缺口。
这三个月，陈掌柜的身子越来越虚，总觉得后颈爬着股凉丝丝的冷意，夜里还总梦到个穿黑衣的男人，攥着那三页残页，对着他笑。他找检测站的老站长问过，老站长说那是凶煞灵根的残灵——当年有个叫赵三的恶徒，偷别人的灵根补自己的，用的就是这类残页，结果补完不到半年就暴毙，残灵留在了青溪镇，专找当年帮过忙的人索灵。
陈掌柜开始四处找那三页残页。他跑遍了镇里的旧书铺，最后在巷口张阿婆的旧书寄卖店摸到了那三页——张阿婆说，这是她二十年前捡的，一直塞在箱底没敢拿出来，因为上面透着股说不出的寒意。陈掌柜捏着残页，指尖都在抖，他想起当年赵三偷了残页补自己的凶煞灵根，后来被镇里的捕快打死，残灵就缠上了他这个帮着整理旧书的人。
补灵的日子定在农历十五，是青溪镇的补灵吉日。陈掌柜把三页残页铺在修书铺的枣木案台上，案上摆着他那本翻得卷了边的纸灵根旧书——缺的三页刚好在中间。他按着老站长的吩咐，把残页一页页贴上去：贴第十七页时，忽然想起当年整理旧书时，自己不小心把这三页掉在地上，被赵三捡走，他当时还追了两步，没追上；贴第二十三页时，瞥见残页上有个模糊的手印，像是赵三的，那手印里裹着股凶煞的冷意；贴第四十一页时，看到残页上有个小痣似的痕迹，是张阿婆当年捡残页时，不小心用墨汁点的，她一直没擦。
贴完最后一页的刹那，陈掌柜忽然觉得一股暖流从指尖窜到心口，后颈的冷意也跟着散了。他抬头看向窗外，那穿黑衣的残灵正站在巷口，对着他鞠了一躬，才慢慢消散。原来补灵的规矩不止是找残页，还要补上当年的因果——陈掌柜当年的错，是没追上赵三，张阿婆的错，是当年没把残页交给检测站，这两个因果补上，残灵便不再索灵，反而得了安息。
打那以后，陈掌柜的身子慢慢养好了，修书铺的生意也越来越红火。他把补灵的规矩写在修书铺的墙上，让每个来修书的人都知道，灵根的缺口得靠因果补全，不能走邪门歪道。青溪镇的灵根检测站，也添了个新规矩：丢了旧书页的人，得在三个月内找到残页补上因果，否则灵根缺口会越来越大，甚至会被凶煞灵根缠上。
